方舟生存进化建设水上基地的方法如下：1、在水面放一个船并在船上搭建木质地基，在搭建好的木质地基上放上柱子；

2、在木质地基上铺满石头，然后再拆除掉之前搭建的木质地基和柱子，在石头地基前面搭建茅草天花板；

3、在茅草天花板后面格子放个柱子，在茅草天花板下面搭上石头地基；

4、重复放置茅草天花板和石头地基，不停重复直到达到建筑上线就完成了水上基地的建造了。